Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms