Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ROPN1BQ9BZX4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms