Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COX10Q12887 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COX10Q12887 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COX10Q12887 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms