Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLEQ07864 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms