Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLCB2Q00722 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CYP2C19-201ENST00000371321 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB2Q00722 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms