Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDIT3P35638 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDIT3P35638 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms