Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXN2P32314 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms