Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms