Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF21BQ96EK2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF21BQ96EK2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms