Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EFHD2Q96C19 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms