Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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