Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms