Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
UBE2V1Q13404 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms