RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545339.5

CD27-AS1-209, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CD27-AS1, Length 1,766 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-209ENST00000545339 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.94■■■□□ 2.38
CD27-AS1-209ENST00000545339 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.3■■□□□ 1.8
CD27-AS1-209ENST00000545339 ABCC9O60706 1549 aa25.32■■□□□ 1.64
CD27-AS1-209ENST00000545339 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CD27-AS1-209ENST00000545339 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.98■■□□□ 1.59
CD27-AS1-209ENST00000545339 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.78■■□□□ 1.56
CD27-AS1-209ENST00000545339 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.7■■□□□ 1.54
CD27-AS1-209ENST00000545339 NACADO15069 1562 aa24.68■■□□□ 1.54
CD27-AS1-209ENST00000545339 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.57■■□□□ 1.52
CD27-AS1-209ENST00000545339 SCRIBQ14160 1630 aa24.08■■□□□ 1.44
CD27-AS1-209ENST00000545339 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.04■■□□□ 1.44
CD27-AS1-209ENST00000545339 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.84■■□□□ 1.41
CD27-AS1-209ENST00000545339 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
CD27-AS1-209ENST00000545339 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.73■■□□□ 1.39
CD27-AS1-209ENST00000545339 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.25■■□□□ 1.31
CD27-AS1-209ENST00000545339 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CD27-AS1-209ENST00000545339 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CD27-AS1-209ENST00000545339 SMARCA4P51532 1647 aa23.07■■□□□ 1.28
CD27-AS1-209ENST00000545339 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.06■■□□□ 1.28
CD27-AS1-209ENST00000545339 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CD27-AS1-209ENST00000545339 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CD27-AS1-209ENST00000545339 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.87■■□□□ 1.25
CD27-AS1-209ENST00000545339 SMARCA2P51531 1590 aa22.87■■□□□ 1.25
CD27-AS1-209ENST00000545339 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.87■■□□□ 1.25
CD27-AS1-209ENST00000545339 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.83■■□□□ 1.25
CD27-AS1-209ENST00000545339 WIZO95785 1651 aa22.8■■□□□ 1.24
CD27-AS1-209ENST00000545339 NCAPD3P42695 1498 aa22.79■■□□□ 1.24
CD27-AS1-209ENST00000545339 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.76■■□□□ 1.23
CD27-AS1-209ENST00000545339 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CD27-AS1-209ENST00000545339 HMGXB3Q12766 1538 aa22.67■■□□□ 1.22
CD27-AS1-209ENST00000545339 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CD27-AS1-209ENST00000545339 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.4■■□□□ 1.18
CD27-AS1-209ENST00000545339 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-209ENST00000545339 CFTRP13569 1480 aa22.12■■□□□ 1.13
CD27-AS1-209ENST00000545339 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.07■■□□□ 1.12
CD27-AS1-209ENST00000545339 NESP48681 1621 aa22.03■■□□□ 1.12
CD27-AS1-209ENST00000545339 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.99■■□□□ 1.11
CD27-AS1-209ENST00000545339 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.91■■□□□ 1.1
CD27-AS1-209ENST00000545339 PRDM2Q13029 1718 aa21.85■■□□□ 1.09
CD27-AS1-209ENST00000545339 ERCC6Q03468 1493 aa21.83■■□□□ 1.09
CD27-AS1-209ENST00000545339 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.83■■□□□ 1.08
CD27-AS1-209ENST00000545339 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
CD27-AS1-209ENST00000545339 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.71■■□□□ 1.07
CD27-AS1-209ENST00000545339 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.7■■□□□ 1.06
CD27-AS1-209ENST00000545339 TRIM41Q8WV44 630 aa21.69■■□□□ 1.06
CD27-AS1-209ENST00000545339 ABCC8Q09428 1581 aa21.69■■□□□ 1.06
CD27-AS1-209ENST00000545339 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.68■■□□□ 1.06
CD27-AS1-209ENST00000545339 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CD27-AS1-209ENST00000545339 CUX1P39880 1505 aa21.6■■□□□ 1.05
CD27-AS1-209ENST00000545339 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.6■■□□□ 1.05
CD27-AS1-209ENST00000545339 TOPBP1Q92547 1522 aa21.59■■□□□ 1.05
CD27-AS1-209ENST00000545339 SYNJ1O43426 1573 aa21.55■■□□□ 1.04
CD27-AS1-209ENST00000545339 TOP2BQ02880 1626 aa21.55■■□□□ 1.04
CD27-AS1-209ENST00000545339 WDR62O43379 1518 aa21.54■■□□□ 1.04
CD27-AS1-209ENST00000545339 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CD27-AS1-209ENST00000545339 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.51■■□□□ 1.03
CD27-AS1-209ENST00000545339 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.47■■□□□ 1.03
CD27-AS1-209ENST00000545339 SOGA1O94964 1423 aa21.44■■□□□ 1.02
CD27-AS1-209ENST00000545339 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CD27-AS1-209ENST00000545339 CUX2O14529 1486 aa21.37■■□□□ 1.01
CD27-AS1-209ENST00000545339 IFT140Q96RY7 1462 aa21.36■■□□□ 1.01
CD27-AS1-209ENST00000545339 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.35■■□□□ 1.01
CD27-AS1-209ENST00000545339 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-209ENST00000545339 KIF27Q86VH2 1401 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-209ENST00000545339 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-209ENST00000545339 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CD27-AS1-209ENST00000545339 EEA1Q15075 1411 aa21.23■□□□□ 0.99
CD27-AS1-209ENST00000545339 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.99
CD27-AS1-209ENST00000545339 HRCP23327 699 aa21.2■□□□□ 0.98
CD27-AS1-209ENST00000545339 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-209ENST00000545339 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-209ENST00000545339 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-209ENST00000545339 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-209ENST00000545339 WDR97A6NE52 1622 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-209ENST00000545339 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-209ENST00000545339 IGF1RP08069 1367 aa21.1■□□□□ 0.97
CD27-AS1-209ENST00000545339 GRIN2BQ13224 1484 aa21.1■□□□□ 0.97
CD27-AS1-209ENST00000545339 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.09■□□□□ 0.97
CD27-AS1-209ENST00000545339 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CD27-AS1-209ENST00000545339 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.05■□□□□ 0.96
CD27-AS1-209ENST00000545339 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.01■□□□□ 0.95
CD27-AS1-209ENST00000545339 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CD27-AS1-209ENST00000545339 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.96■□□□□ 0.95
CD27-AS1-209ENST00000545339 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.96■□□□□ 0.95
CD27-AS1-209ENST00000545339 PBRM1Q86U86 1689 aa20.95■□□□□ 0.94
CD27-AS1-209ENST00000545339 PRXQ9BXM0 1461 aa20.94■□□□□ 0.94
CD27-AS1-209ENST00000545339 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CD27-AS1-209ENST00000545339 CUL7Q14999 1698 aa20.93■□□□□ 0.94
CD27-AS1-209ENST00000545339 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.91■□□□□ 0.94
CD27-AS1-209ENST00000545339 FBLN2P98095 1184 aa20.91■□□□□ 0.94
CD27-AS1-209ENST00000545339 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.88■□□□□ 0.93
CD27-AS1-209ENST00000545339 SYNJ2O15056 1496 aa20.88■□□□□ 0.93
CD27-AS1-209ENST00000545339 ADAMTS12P58397 1594 aa20.86■□□□□ 0.93
CD27-AS1-209ENST00000545339 KIF21BO75037 1637 aa20.86■□□□□ 0.93
CD27-AS1-209ENST00000545339 GOLGA3Q08378 1498 aa20.86■□□□□ 0.93
CD27-AS1-209ENST00000545339 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CD27-AS1-209ENST00000545339 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.84■□□□□ 0.93
CD27-AS1-209ENST00000545339 GRIN2AQ12879 1464 aa20.79■□□□□ 0.92
CD27-AS1-209ENST00000545339 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.71■□□□□ 0.91
CD27-AS1-209ENST00000545339 OSCARQ8IYS5 282 aa20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms