Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFLP07196 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEFLP07196 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEFLP07196 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEFLP07196 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEFLP07196 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEFLP07196 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEFLP07196 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEFLP07196 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEFLP07196 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms