Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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