Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.197e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 THOC7-204ENST00000469584 836 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.247e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 213.33□□□□□ -0.287e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MRPL35-204ENST00000605125 833 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.317e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DPH2-211ENST00000527319 643 ntTSL 512.9□□□□□ -0.343e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 KCTD20-204ENST00000449081 4094 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.363e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-204ENST00000527906 604 ntTSL 312.62□□□□□ -0.397e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 YOD1-201ENST00000315927 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.427e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-207ENST00000403642 1359 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.467e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-219ENST00000448511 1532 ntTSL 212.14□□□□□ -0.477e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-208ENST00000404276 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.497e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRUNE1-201ENST00000271620 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.497e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-221ENST00000456369 588 ntTSL 311.77□□□□□ -0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ARPC4-205ENST00000467289 729 ntTSL 211.77□□□□□ -0.533e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-209ENST00000405598 1959 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.547e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-211ENST00000417588 1551 ntTSL 211.52□□□□□ -0.577e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-214ENST00000433728 1580 ntTSL 211.52□□□□□ -0.577e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NABP2-205ENST00000447747 770 ntTSL 511.48□□□□□ -0.577e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-206ENST00000402731 1545 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.647e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRUNE1-203ENST00000368935 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.667e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-223ENST00000472807 514 ntTSL 210.86□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRUNE1-204ENST00000368936 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.717e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-215ENST00000434810 984 ntTSL 310.59□□□□□ -0.717e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.917e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DHX15-206ENST00000510645 470 ntTSL 59.33□□□□□ -0.923e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-210ENST00000556463 3584 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.967e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.037e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.047e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 GAMT-203ENST00000591788 401 ntTSL 58.36□□□□□ -1.077e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.197e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DHX15-209ENST00000513036 1848 ntTSL 27.28□□□□□ -1.243e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.257e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-209ENST00000496533 657 ntTSL 37.23□□□□□ -1.257e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.277e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DHX15-208ENST00000512903 2071 ntTSL 26.09□□□□□ -1.433e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.497e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 INAFM2-201ENST00000560415 594 ntTSL 25.73□□□□□ -1.497e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)5.6□□□□□ -1.517e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 OLA1-209ENST00000497760 722 ntTSL 24.72□□□□□ -1.657e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ARL8B-206ENST00000468010 452 ntTSL 54.41□□□□□ -1.73e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)4.28□□□□□ -1.723e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TRA2B-201ENST00000259043 943 ntTSL 37.13□□□□□ -1.271e-7■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.731e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MTX2-202ENST00000420864 1592 ntTSL 1 (best)25.45■■□□□ 1.661e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SEC13-218ENST00000490283 740 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SEC13-215ENST00000477547 1313 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SEC13-214ENST00000476597 614 ntTSL 213.09□□□□□ -0.311e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 RPL19-208ENST00000585199 402 ntTSL 212.67□□□□□ -0.389e-58■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MZT2A-206ENST00000491265 2826 ntTSL 224.43■■□□□ 1.53e-7■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.464e-9■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TKT-214ENST00000494523 1955 ntTSL 214.78□□□□□ -0.044e-9■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HSPH1-207ENST00000626866 4381 ntTSL 22.45□□□□□ -2.024e-9■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 LAMTOR5-205ENST00000531779 569 ntTSL 226.51■■□□□ 1.834e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.53e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SMG5-204ENST00000476954 1161 ntTSL 219.27■□□□□ 0.683e-7■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-19■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-7■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 FXYD5-206ENST00000496493 729 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-16■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 216.4■□□□□ 0.224e-8■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.61e-16■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.381e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.291e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.511e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AGAP3-225ENST00000498559 581 ntTSL 221.84■■□□□ 1.091e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.271e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AGAP3-213ENST00000475145 413 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 C7orf73-204ENST00000515197 617 ntTSL 28.56□□□□□ -1.041e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 ABCF1-206ENST00000479542 893 ntTSL 216.42■□□□□ 0.223e-10■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 EIF3B-212ENST00000494658 637 ntTSL 221.42■■□□□ 1.027e-20■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 ARF1-209ENST00000478424 1059 ntTSL 230.31■■■□□ 2.441e-46■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.691e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SNRPF-203ENST00000551316 787 ntTSL 217.03■□□□□ 0.321e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-11■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.293e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-216ENST00000509031 1177 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.013e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.933e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SFT2D1-202ENST00000478705 659 ntTSL 220.12■□□□□ 0.813e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.763e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-203ENST00000351450 1072 ntTSL 218.05■□□□□ 0.483e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 217.07■□□□□ 0.323e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.33e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.33e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.133e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.492e-17■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-219ENST00000513605 982 ntTSL 26.93□□□□□ -1.33e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PPA2-222ENST00000515567 368 ntTSL 56.93□□□□□ -1.33e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SFT2D1-205ENST00000488773 546 ntTSL 56.85□□□□□ -1.313e-9■□□□□ 8.4
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