Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms