Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QRK9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QRK9 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms