Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP350Q5VT06 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms