Protein–RNA interactions for Protein: Q15669

RHOH, Rho-related GTP-binding protein RhoH, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOHQ15669 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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RHOHQ15669 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RHOHQ15669 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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