Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSPG4P5Q96PW8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms