Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms