Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NKPD1Q17RQ9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms