Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKPD1Q17RQ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKPD1Q17RQ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKPD1Q17RQ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKPD1Q17RQ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKPD1Q17RQ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NKPD1Q17RQ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKPD1Q17RQ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKPD1Q17RQ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NKPD1Q17RQ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKPD1Q17RQ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKPD1Q17RQ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKPD1Q17RQ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKPD1Q17RQ9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKPD1Q17RQ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NKPD1Q17RQ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKPD1Q17RQ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKPD1Q17RQ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKPD1Q17RQ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKPD1Q17RQ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKPD1Q17RQ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKPD1Q17RQ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKPD1Q17RQ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKPD1Q17RQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKPD1Q17RQ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKPD1Q17RQ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKPD1Q17RQ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKPD1Q17RQ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKPD1Q17RQ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKPD1Q17RQ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKPD1Q17RQ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKPD1Q17RQ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKPD1Q17RQ9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKPD1Q17RQ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKPD1Q17RQ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKPD1Q17RQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKPD1Q17RQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKPD1Q17RQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKPD1Q17RQ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKPD1Q17RQ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKPD1Q17RQ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKPD1Q17RQ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKPD1Q17RQ9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKPD1Q17RQ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKPD1Q17RQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKPD1Q17RQ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKPD1Q17RQ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKPD1Q17RQ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKPD1Q17RQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKPD1Q17RQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKPD1Q17RQ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKPD1Q17RQ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKPD1Q17RQ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKPD1Q17RQ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKPD1Q17RQ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKPD1Q17RQ9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKPD1Q17RQ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKPD1Q17RQ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKPD1Q17RQ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKPD1Q17RQ9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKPD1Q17RQ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKPD1Q17RQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NKPD1Q17RQ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKPD1Q17RQ9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKPD1Q17RQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKPD1Q17RQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKPD1Q17RQ9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKPD1Q17RQ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKPD1Q17RQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKPD1Q17RQ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKPD1Q17RQ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKPD1Q17RQ9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKPD1Q17RQ9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKPD1Q17RQ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKPD1Q17RQ9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKPD1Q17RQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKPD1Q17RQ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKPD1Q17RQ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKPD1Q17RQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NKPD1Q17RQ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKPD1Q17RQ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKPD1Q17RQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKPD1Q17RQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKPD1Q17RQ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKPD1Q17RQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKPD1Q17RQ9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKPD1Q17RQ9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKPD1Q17RQ9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKPD1Q17RQ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKPD1Q17RQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKPD1Q17RQ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKPD1Q17RQ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NKPD1Q17RQ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKPD1Q17RQ9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKPD1Q17RQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKPD1Q17RQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKPD1Q17RQ9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKPD1Q17RQ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKPD1Q17RQ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKPD1Q17RQ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms