Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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