Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP1Q04837 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP1Q04837 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP1Q04837 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms