Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms