Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms