Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms