Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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COL4A6Q14031 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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COL4A6Q14031 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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COL4A6Q14031 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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COL4A6Q14031 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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COL4A6Q14031 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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COL4A6Q14031 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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COL4A6Q14031 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms