Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GTF3C3Q9Y5Q9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms