Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMEB2Q9UKD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMEB2Q9UKD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMEB2Q9UKD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms