Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TSKSQ9UJT2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSKSQ9UJT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms