Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSR3Q9UJK0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR3Q9UJK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms