Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATPIF1Q9UII2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATPIF1Q9UII2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms