Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms