Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF9Q9P2J2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9Q9P2J2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9Q9P2J2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms