Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM79Q9BSE2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM79Q9BSE2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms