Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRQ99707 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRQ99707 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRQ99707 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRQ99707 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRQ99707 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRQ99707 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRQ99707 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRQ99707 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRQ99707 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRQ99707 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTRQ99707 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTRQ99707 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTRQ99707 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTRQ99707 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTRQ99707 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTRQ99707 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRQ99707 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRQ99707 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRQ99707 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRQ99707 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRQ99707 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRQ99707 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRQ99707 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRQ99707 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRQ99707 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRQ99707 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRQ99707 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRQ99707 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRQ99707 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRQ99707 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRQ99707 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRQ99707 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRQ99707 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRQ99707 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRQ99707 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRQ99707 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRQ99707 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRQ99707 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRQ99707 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRQ99707 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRQ99707 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRQ99707 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRQ99707 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTRQ99707 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTRQ99707 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTRQ99707 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTRQ99707 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTRQ99707 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MTRQ99707 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms