Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC9Q96Q05 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms