Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RNFT2Q96EX2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms