Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUH8

SPPL2C, Signal peptide peptidase-like 2C, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2CQ8IUH8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPPL2CQ8IUH8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2CQ8IUH8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms