Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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