Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGEF1BQ0VAM2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms