Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF11Q05519 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms