Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCP4P48539 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCP4P48539 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCP4P48539 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCP4P48539 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCP4P48539 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCP4P48539 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCP4P48539 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCP4P48539 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCP4P48539 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCP4P48539 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCP4P48539 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCP4P48539 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms