Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP3P42574 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP3P42574 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP3P42574 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP3P42574 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP3P42574 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP3P42574 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP3P42574 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP3P42574 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP3P42574 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP3P42574 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP3P42574 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP3P42574 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP3P42574 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP3P42574 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP3P42574 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP3P42574 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP3P42574 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP3P42574 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP3P42574 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP3P42574 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP3P42574 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP3P42574 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP3P42574 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP3P42574 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms