Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6V1E1P36543 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6V1E1P36543 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms