Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH4A1P30038 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH4A1P30038 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH4A1P30038 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH4A1P30038 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH4A1P30038 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH4A1P30038 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALDH4A1P30038 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH4A1P30038 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms